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銀杏的學(xué)名為Ginkgo biloba L.，系瑞典植物學(xué)家林奈（Linnaeus）于1771年根據(jù)肯普弗（E.Kaempfer）的材料定名。銀杏是銀杏目中僅存的代表樹種，是我國特有的珍貴樹種之一，是現(xiàn)存植物中最古老的裸子植物。銀杏生存發(fā)展的歷史悠久而又曲折，輝煌而又多舛。
多數(shù)植物學(xué)家認(rèn)為，銀杏類植物的發(fā)生始自古生代的上石炭紀(jì)（距今約28－35億年），銀杏目可能由科狄達(dá)目（Cordaitales）演進(jìn)而成，或與之同源。科狄達(dá)目系遠(yuǎn)古的一種喬木，高達(dá)二三十米，在石炭紀(jì)時代極為繁茂。古生代上石炭紀(jì)的銀杏類植物代表是二歧葉屬，其營養(yǎng)枝和木質(zhì)部極近似于當(dāng)前的銀杏目。在古生代二疊紀(jì)出現(xiàn)了毛狀葉屬，該屬的葉子比二歧葉屬更細(xì)長。
古生代下二疊紀(jì)至下白堊紀(jì)出現(xiàn)了楔拜拉屬，該屬具有典型銀杏目的特征，極像原始狀態(tài)的銀杏。中生代三疊紀(jì)起，又出現(xiàn)了茨康葉屬、拜拉屬、擬刺葵屬、舌葉屬、哈茲屬、似管狀葉屬等。中生代侏羅紀(jì)后，地球上的氣候漸趨干旱，銀杏類植物急劇分化，銀杏家族中又增添了似銀杏屬、假托勒里葉屬、漿葉屬和銀杏屬。
晚侏羅紀(jì)至早白堊紀(jì)是銀杏目的全盛期，銀杏類植物有20余屬150余種，廣泛分布在亞洲、歐洲、美洲、非洲、大洋洲等許多地區(qū)。僅在中國發(fā)現(xiàn)的就有10多個屬100余種，占銀杏類植物的近三分之二。從中生代白堊紀(jì)至新生代第三紀(jì)早期，北半球許多地區(qū)發(fā)生山脈隆起和海底上升成為陸地的地質(zhì)運動，氣候發(fā)生巨大變化，銀杏類植物在世界各地進(jìn)入極衰時期，銀杏類家族中大多數(shù)屬種由于氣候轉(zhuǎn)冷而相繼消失，只剩下銀杏屬和似銀杏屬。
到了新生代的第三紀(jì)末和第四紀(jì)初，地球氣候劇變，進(jìn)入冰川期和間冰川期，地球上的動植物發(fā)生了根本性變化，銀杏類植物在歐洲及北美各地蕩然無存，在亞洲也瀕臨絕跡。只有銀杏屬中的銀杏，作為銀杏類植物的杰出代表，以其頑強的生命力和適應(yīng)能力歷盡滄桑；同時因為我國位于亞洲大陸的東北端，山脈大多為東西走向，銀杏得以在中國亞熱帶山岳地區(qū)有了避難所。后來，銀杏又由中國向世界各地傳播擴展。
2003年6月19日出版的英國《自然》雜志發(fā)表了中國科學(xué)家一項研究成果發(fā)現(xiàn)了銀杏演化史中一個缺失的鏈環(huán)。中國科學(xué)院南京地質(zhì)古生物研究所周志炎院士和沈陽地質(zhì)礦產(chǎn)研究所鄭少林研究員通過合作研究，發(fā)現(xiàn)遼寧西部義縣早白堊紀(jì)(距今12億年前)具有繁殖器官的銀杏化石，從而填補了銀杏演化歷史中一段長達(dá)1億多年的空白。
遼寧早白堊紀(jì)銀杏化石的形態(tài)介于已知最古老的銀杏和現(xiàn)存的銀杏之間，但更接近于現(xiàn)存銀杏。它不僅是一個缺失的鏈環(huán)，而且顯示出1?2億年以來銀杏在演化中的滯遲現(xiàn)象。科學(xué)家稱這一發(fā)現(xiàn)是銀杏研究的重要里程碑。